准确规范地标注参考文献，是对其他创作者劳动创造成果的肯定，是对其他作者权益保护的肯定，也有利于读者对相关文献资料的追踪和检索。然而，学术期刊在参考文献标注上仍存在一些问题，主要表现在以下几个方面。

1。参考文献标注不完整或标注不够统一
例如，文献类型标志，其中一个样本期刊从调查中没有标记的文件类型，而其他类型的参考文献标注被混淆，从而产生了许多问题。例如，会议文件和收藏标志[A]或[B]，如何标注不同类型的电子参考文献，分析出来的文献类型标记和原始文献是否都有标记，或者是否只有一份文献别标记了。汇编和参考工具，如何标注这两种不同类型的参考文献呢，如何对100多年以前出版的古籍进行标号，这些都存在着标准不统一、规范不一的情况。是否有必要标明页码，以供参考期刊文章？在20种期刊中，8种没有标明起始页码和结尾页码，另外12种有不同的起始页码和结束页码。其中一些被列在文章后面的参考资料中，有些不是开头和结尾的页码，而只是引文页码。此外，普通书刊、报纸文件、出版社或学位论文责任单位在出版标签前的数量或版本、电子文件的发表或更新日期和引用日期也不一致。
    2.项目顺序错误
根据一般规范，主要负责人(如作者、编辑)应列在参考文献的前面，其他负责人(如校验者、译者、注释者)应放在文件类型标记之后。其次是原稿，最后是主要负责人；此外，有些稿件还受到对出版年度文献的注释方式的影响，直接将出版年份置于主要负责人之后。
    3.标点符号标注混乱
参考文献中各项目的编目顺序、标点符号和符号具有检索的意义，不能随意标注。许多撰稿人在标明负责文件的两个或两个以上的人时，应使用逗号，而不应在文件中在外国人姓名的姓和名之间加上一个圆点。普通图书出版商应该使用逗号，但是有的却用了句号。在出版年之间。在统计的20种期刊中，15家用的冒号，另外5家用的是句号。从出版年份到发行数量，有13家没有添加，只有7家添加了。
    ​4。文中引用的标签并不统一。
参考文献引用是文本引用部分的相应注释。然而，在后文参考注释中不仅存在许多问题，而且文献中的注释也是“混乱”的。例如，本文中参考编号的位置，在20种期刊中，标点符号前面有编码的有11家，标点符号和下一句之间有8种，序号用字母p（page）编号，有些没有字母，有的直接用p1,p2来编号。例如，一篇文章中有许多对同一文档的引用，其中大多数是用文本中相同序号的不同页码标记的，但也有一些作者每次引用和标记不同的序列号；一次引用一份文档，即文本中序号后面的页码，但在后参考文献中也有标记。